In Bereichen, in denen sowohl die Kantone als auch der Bund zuständig sind, arbeiten diese zusammen. Ansprechpartnerin für den Bund ist die EDK. Auf Bundesseite ist das Staatssekretariat für Bildung, Forschung und Innovation (SBFI) im Eidgenössisches Departement für Wirtschaft, Bildung und Forschung (WBF) für Bildungsfragen zuständig.

Im Bereich der Hochschulen führen Bund und Kantone sowie die Kantone untereinander entsprechende Koordinationsorgane und haben gemeinsame Vereinbarungen erlassen.